''Flavobacterium'' is a genus of
Gram-negative
Gram-negative bacteria are bacteria that, unlike gram-positive bacteria, do not retain the crystal violet stain used in the Gram staining method of bacterial differentiation. Their defining characteristic is that their cell envelope consists ...
,
nonmotile and motile,
rod-shaped bacteria
Bacteria (; : bacterium) are ubiquitous, mostly free-living organisms often consisting of one Cell (biology), biological cell. They constitute a large domain (biology), domain of Prokaryote, prokaryotic microorganisms. Typically a few micr ...
that consists of 130 recognized species.
Flavobacteria are found in soil and fresh water in a variety of environments. Several species are known to cause disease in freshwater fish.
''
Flavobacterium psychrophilum'' causes the
bacterial cold water disease on
salmonids and the rainbow trout fry disease on
rainbow trout
The rainbow trout (''Oncorhynchus mykiss'') is a species of trout native to cold-water tributary, tributaries of the Pacific Ocean in North America and Asia. The steelhead (sometimes called steelhead trout) is an Fish migration#Classification, ...
.
''
F. columnare'' causes the
cotton-wool disease on freshwater fishes.
''
F. branchiophilum'' causes the bacterial gill disease on
trout. Another member of this genus, ''
F. okeanokoites'' is the original source for the type IIs
restriction endonuclease
A restriction enzyme, restriction endonuclease, REase, ENase or'' restrictase '' is an enzyme that cleaves DNA into fragments at or near specific recognition sites within molecules known as restriction sites. Restriction enzymes are one class o ...
''Fok''I, used in
Zinc finger nucleases and
TALENs.
Species who are a part of the genus ''Flavobacterium'' are most likely found scattered along in nature. These microbes are mostly found in aquatic ecosystems and wet areas with freshwater or seawater.
Species
The genus ''Flavobacterium'' comprises the following species:
''
F. acidificum''
''
F. aciduliphilum''
'' F. acidurans''
'' F. agri''
'' F. agrisoli''
'' F. ahnfeltiae''
'' F. ajazii''
'' F. album''
'' F. algicola''
'' F. alkalisoli''
'' F. ammonificans''
'' F. ammoniigenes''
'' F. amnicola''
'' F. amnigenum''
'' F. anatoliense''
'' F. anhuiense''
'' F. antarcticum''
'' F. aquaticum''
'' F. akiainvivens''
'' F. aquariorum''
'' F. aquatile''
'' F. aquicola''
'' F. aquidurense''
'' F. aquimarinum''
'' F. araucananum''
'' F. arcticum''
'' F. arsenatis''
'' F. arsenitoxidans''
'' F. aurantiibacter''
'' F. aureus''
'' F. banpakuense''
'' F. baculatum''
'' F. beibuense''
'' F. bernardetii''
'' F. bizetiae''
'' F. bomense''
'' F. bomensis''
'' F. branchiarum''
'' F. branchiicola''
'' F. branchiophilum''
'' F. breve''
'' F. brevivitae''
'' F. buctense''
'' F. caeni''
'' F. caseinilyticum''
'' F. cauense''
'' F. cellulosilyticum''
'' F. ceti''
'' F. cerinum''
'' F. cheniae''
'' F. cheongpyeongense''
'' F. cheonanense''
'' F. cheonhonense''
'' F. chilense''
'' F. chryseum''
'' F. chungangense''
'' F. chungbukense''
'' F. chungnamense''
'' F. circumlabens''
'' F. collinsense''
'' F. collinsii''
'' F. columnare''
'' F. compostarboris''
'' F. commune''
'' F. coralii''
'' F. covae''
'' F. crassostreae''
'' F. croceum''
'' F. crocinum''
'' F. cucumis''
'' F. cupreum''
'' F. cutihirudinis''
'' F. cyanobacteriorum''
'' F. daejeonense''
'' F. daemonensis''
'' F. dankookense''
'' F. dasani''
'' F. dauae''
'' F. davisii''
'' F. defluvii''
'' F. degerlache''
'' F. denitrificans''
'' F. devorans''
'' F. difficile''
'' F. dispersum''
'' F. dongtanense''
'' F. eburneum''
'' F. endophyticum''
'' F. endoglycinae''
'' F. enshiense''
'' F. faecale''
'' F. ferrugineum''
'' F. filum''
'' F. flaviflagrans''
'' F. flevense''
'' F. fluviale''
'' F. fluviatile''
'' F. fluvii''
'' F. fontis''
'' F. franklandianum''
'' F. frigidarium''
'' F. frigidimaris''
'' F frigoris''
'' F. fryxellicola''
'' F. fulvum''
'' F. gelidilacus''
'' F. gawalongense''
'' F. gillisiae''
'' F. ginsengisoli''
'' F. ginsenosidimutans''
'' F. glaciei''
'' F. glycines''
'' F. granuli''
'' F. halmophilum''
'' F. hankyongi''
'' F. haoranii''
'' F. hauense''
'' F. hercynium''
'' F. hibernum''
'' F. hiemivividum''
'' F. humi''
'' F. humicola''
'' F. hydatis''
'' F. hydrocarbonoxydans''
'' F. hydrophilum''
'' F. ichthyis''
'' F. indicum''
'' F. inkyongense''
'' F. inviolabile''
'' F. jejuense''
'' F. jocheonensis''
'' F. johnsoniae''
'' F. jumunjinense''
'' F. kingsejongi''
'' F. knui''
'' F. koreense''
'' F. kyungheense''
'' F. lacicola''
'' F. lacunae''
'' F. lacus''
'' F. laiguense''
'' F. limicola''
'' F. limnosediminis''
'' F. lindanitolerans''
'' F. longum''
'' F. lotistagni''
'' F. luticocti''
'' F. lutivivi''
'' F. macrobrachii''
'' F. magnum''
'' F. maotaiense''
'' F. marinum''
'' F. maris''
'' F.microcysteis''
'' F. micromati''
'' F. mizutaii''
'' F. muglaense''
'' F. myungsuense''
'' F. multivorum''
'' F. nackdongense''
'' F. naphthae''
'' F. nitratireducens''
'' F. nitrogenifigens''
'' F. niveum''
'' F. noncentrifugens''
'' F. notoginsengisoli''
'' F. oceanosedimentum''
'' F. omnivorum''
'' F. oncorhynchi''
'' F. okeanokoites''
'' F. orientale''
'' F. oreochromis''
'' F. oryzae''
'' F. panici''
'' F. palustre''
'' F. paronense''
'' F. parvum''
'' F. pectinovorum''
'' F. pedocola''
'' F. petrolei''
'' F. phocarum''
'' F. phragmitis''
'' F. phycosphaerae''
'' F. piscinae''
'' F. piscis''
'' F. plurextorum''
'' F. pokkalii''
'' F. ponti''
'' F. procerum''
'' F. profundi''
'' F. psychrolimnae''
'' F. psychrophilum''
'' F. psychroterrae''
'' F. psychrotolerans''
'' F. qiangtangense''
'' F. rakeshii''
'' F. ranwuense''
'' F. reichenbachii''
'' F. resistens''
'' F restrictum''
'' F. rhamnosiphilum''
'' F. riviphilum''
'' F. rivuli''
'' F. saccharophilum''
'' F. saliperosum''
'' F. salilacus''
'' F. salmonis''
'' F. sandaracinum''
'' F. sangjuense''
'' F. sasangense''
'' F. segetis''
'' F. sediminilitoris''
'' F. sediminis''
'' F. selenitireducens''
'' F. seoulense''
'' F. sharifuzzamanii''
'' F. silvaticum''
'' F. silvisoli''
'' F. sinopsychrotolerans''
'' F. soli''
'' F. solisilvae''
'' F. spartansii''
'' F. squillarum''
'' F. stagni''
'' F. suaedae''
'' F. subsaxonicum''
'' F. succinans''
'' F. suncheonense''
'' F. supellecticarium''
'' F. suzhouense''
'' F. swingsii''
'' F. tagetis''
'' F. tangerina''
'' F. tangerinum''
'' F. tegetincola''
'' F. terrae''
'' F. terrigena''
'' F. terriphilum''
'' F. thermophilum''
'' F. tiangeerense''
'' F. tibetense''
'' F. tilapiae''
'' F. tistrianum''
'' F. tructae''
'' F. tyrosinilyticum''
'' F. ummariense''
'' F. undicola''
'' F. ureilyticum''
'' F. urocaniciphilum''
'' F. urumqiense''
'' F. verecundum''
'' F. vireti''
'' F. viscosum''
'' F. weaverense''
'' F. xanthum''
'' F. xinjiangense''
'' F. xueshanense''
'' F. yanchengense''
'' F. yonginense''
'' F. zaozhuangense''
'' F. zepuense''
'' F. zettnowii''
'' F. zhairuonense''
'' F. zhairuonensis''[
]
References
{{Authority control
Bacterial diseases of fish
Gram-negative bacteria
Bacteria genera
Bacteria described in 1923